BRPI ditetapkan oleh Kemenristekdikti sebagai Pusat Unggulan Iptek Pemuliaan Ikan dalam pembinaan.

1. Komite Akreditasi Nasional (KAN) 

Nomor Akreditasi : LP-919-IDN (Laboratorium Penguji) tahun 2015

        2. Cara Karantina Ikan yang Baik (CKIB)

Nomor Akreditasi : 003/CKIB-37.0/XII/2015

3. Instalasi Karantina Ikan (SIKI)

Nomor Akreditasi : 000120/IKI-BKIPM.2/XI/2016

4. ISO 9001: 2015

QAIS-Q-INDO-BR-01.18.044 8 Maret 2018